拉曼扫描数据分析

这是一个拉曼扫描数据处理程序。算法位于 raman/，面向实际数据的独立步骤位于 work/。安装依赖后：

conda activate raman

python -m pip install -r requirements.txt
python work/baseline/baseline_scan.py
python work/fitting/fit_scan.py

上面两条命令分别生成背景和逐点峰拟合参数。重建、拟合效果评估、光谱加减和绘图也都是独立脚本；完整的文件职责、参数说明和可复制命令见 work/README.md，各子目录下的 README 还提供对应步骤的细节。

文件说明

• work/baseline/baseline_scan.py：逐空间点估计背景，输出 background.tif（说明）。
• work/fitting/fit_scan.py：逐空间点检测峰并拟合，输出长表 fit_parameters.csv（说明）。
• work/reconstruction/：从参数重建分峰/总谱，并提供谱线加减运算（说明）。
• work/evaluation/：比较目标拉曼谱和拟合结果谱，输出整体及快速变化部分的拟合指标（说明）。
• work/visualization/：只读取已有结果并绘图（说明）。
• raman/io/：TXT 与 TIFF 数据读取实现；可用读取器在 raman/io/__init__.py 中列出。
• raman/baseline/：AsLS 与 airPLS 基线矫正实现；可用方法在 raman/baseline/__init__.py 中列出。
• raman/fitting/：单条光谱的峰检测及 Gaussian、Lorentzian、Voigt 拟合；可用方法在 raman/fitting/__init__.py 中列出。
• raman/reconstruction/：Gaussian、Lorentzian、Voigt 单条谱线重建函数。

基线、拟合和重建脚本在顶部直接写出读取器、算法、参数、路径和循环范围，修改后运行 python xxx.py 即可。TIFF 统一按 (y, x, Raman shift) 处理。